Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPTAN1Q13813 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTAN1Q13813 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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