Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RUNX3Q13761 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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