Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1SQ13698 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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