Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA7Q13683 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms