Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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IRF5Q13568 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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IRF5Q13568 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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IRF5Q13568 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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IRF5Q13568 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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IRF5Q13568 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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IRF5Q13568 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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IRF5Q13568 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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IRF5Q13568 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF5Q13568 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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