Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LSAMPQ13449 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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