Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATMQ13315 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATMQ13315 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATMQ13315 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATMQ13315 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATMQ13315 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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