Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDZK1IP1Q13113 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms