Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ECH1Q13011 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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