Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
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