Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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RAB40BQ12829 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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RAB40BQ12829 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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RAB40BQ12829 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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RAB40BQ12829 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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