Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CYP4F3Q08477 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms