Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DEUP1Q05D60 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEUP1Q05D60 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms