Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GRIN1Q05586 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms