Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EMX1Q04741 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms