Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLOD1Q02809 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms