Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUD4Q01804 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms