Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF9Q00978 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms