Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB1P82279 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB1P82279 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB1P82279 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB1P82279 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB1P82279 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB1P82279 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB1P82279 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB1P82279 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB1P82279 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB1P82279 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB1P82279 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB1P82279 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms