Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SIM1P81133 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SIM1P81133 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SIM1P81133 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SIM1P81133 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SIM1P81133 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SIM1P81133 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIM1P81133 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms