Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA1P56159 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms