Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP6P55212 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP6P55212 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms