Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM4P49221 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM4P49221 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM4P49221 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGM4P49221 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGM4P49221 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TGM4P49221 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGM4P49221 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGM4P49221 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGM4P49221 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGM4P49221 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGM4P49221 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGM4P49221 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM4P49221 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM4P49221 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGM4P49221 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms