Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHKA1P46020 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHKA1P46020 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms