Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDH1P40925 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDH1P40925 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDH1P40925 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MDH1P40925 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MDH1P40925 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MDH1P40925 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MDH1P40925 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MDH1P40925 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MDH1P40925 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms