Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2IP36954 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms