Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXC12P31275 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms