Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
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PTPRMP28827 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRMP28827 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
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PTPRMP28827 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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PTPRMP28827 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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PTPRMP28827 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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PTPRMP28827 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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PTPRMP28827 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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PTPRMP28827 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
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PTPRMP28827 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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PTPRMP28827 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRMP28827 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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