Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXD10P28358 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms