Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD27P26842 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD27P26842 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD27P26842 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD27P26842 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD27P26842 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CD27P26842 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CD27P26842 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD27P26842 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD27P26842 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD27P26842 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD27P26842 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD27P26842 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD27P26842 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD27P26842 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD27P26842 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD27P26842 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD27P26842 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD27P26842 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD27P26842 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD27P26842 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD27P26842 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD27P26842 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD27P26842 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD27P26842 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD27P26842 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD27P26842 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD27P26842 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD27P26842 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD27P26842 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD27P26842 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD27P26842 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD27P26842 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD27P26842 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD27P26842 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD27P26842 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD27P26842 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD27P26842 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD27P26842 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD27P26842 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms