Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMLP26374 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMLP26374 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMLP26374 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMLP26374 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHMLP26374 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMLP26374 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMLP26374 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms