Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYF6P23409 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYF6P23409 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MYF6P23409 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MYF6P23409 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MYF6P23409 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MYF6P23409 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MYF6P23409 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MYF6P23409 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MYF6P23409 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MYF6P23409 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms