Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGA6P23229 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA6P23229 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms