Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMY2BP19961 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms