Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR2CP19387 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2CP19387 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms