Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF3P18847 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF3P18847 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF3P18847 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF3P18847 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF3P18847 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF3P18847 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms