Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRAP18433 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRAP18433 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRAP18433 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRAP18433 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTPRAP18433 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRAP18433 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
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