Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD8P13378 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD8P13378 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms