Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RLBP1P12271 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RLBP1P12271 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms