Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEFHP12036 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEFHP12036 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEFHP12036 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEFHP12036 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms