Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DMDP11532 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DMDP11532 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DMDP11532 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DMDP11532 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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