Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN2P0C2S0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms