Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF1P09603 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSF1P09603 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSF1P09603 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms