Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIL1P09327 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIL1P09327 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIL1P09327 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VIL1P09327 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VIL1P09327 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VIL1P09327 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VIL1P09327 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VIL1P09327 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms