Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-HP01893 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms