Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TOMM40O96008 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TOMM40O96008 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TOMM40O96008 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TOMM40O96008 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TOMM40O96008 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TOMM40O96008 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOMM40O96008 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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