Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
POLR1AO95602 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1AO95602 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms