Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF3O95398 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RAPGEF3O95398 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF3O95398 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF3O95398 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF3O95398 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms