Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM37O94972 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM37O94972 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms