Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PITX3O75364 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PITX3O75364 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX3O75364 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PITX3O75364 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PITX3O75364 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PITX3O75364 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms